民國104年起，出生2個月至5歲之幼兒，以可免費接種三劑13價肺炎鏈球菌疫苗，若幼兒以前曾接種過肺炎鏈球菌疫苗，請先洽詢所在地衛生所。

105年4月18日起，公費PCV13實施對象為出生滿2個月以上至未滿60個月，未曾接種或尚未完成PCV13之幼童。

112年10月2日起擴大65歲以上族群公費接種1劑PCV及1劑PPV23
1.從未曾接種過PCV13/15及PPV23者，112/11/27起可公費接種1劑PCV13，間隔至少1年後(高風險對象間隔至少8週)再接種1劑公費PPV23。

2.曾經接種PPV23者，間隔至少1年後，112/12/25起可公費接種1劑PCV13。

114年3月1日起提供19-64歲侵襲性肺炎鏈球菌感染症（IPD）高風險對象公費接種1劑PCV及1劑PPV23，需帶(IPD)之佐證文件。

114年8月1日起提供55~64歲原住民公費接種1劑PCV及1劑PPV23，需帶戶籍謄本註記族籍。